بعد الحرب العالمية الثانية طورت منظمة قادة التحالف في اليابان وكالة جديدة للمساعدة في إدارة حوادث الإرهاب والعنف داخل منطقة المحيط الهادئ كانت الوكالة مزودة بأفراد من النينجا وكُلفوا في البداية بمعالجة الشؤون الداخلية ولكن لاحقاً تطور هذا البرنامج إلى شكله الحالي حيث يتم إدارة حوالي 20.000 عضو من النينجا من قِبل مجموعة مدراء من الشؤون الداخلية والدولية أحد هؤلاء النينجا هو كودو يستعد الآن الفتى الفاشل في المدرسة الثانوية البالغ من العمر17 عامًا ليكون الحامي في خط الدفاع التالي ضد الزيادة المحتملة في عدد القتلة الأجانب الذين يغزون طوكيو.